Die Forschungen des IZS werden geleitet vom Forschungsprogramm des IÖR und sind dem Forschungsbereich Transformative Kapazitäten zugeordnet. Die Leitfragen dieses Forschungsbereichs sind:
Im Rahmen dieses Forschungsbereichs und seiner Leitfragen werden im IZS spezifische Aspekte zum transformativen Wandel in Klein- und Mittelstädten in peripheren Lagen sowie in vom Strukturwandel betroffenen Regionen vertieft. Hiermit ist das IZS ebenfalls eingebettet in das Forschungsprofil des IHI Zittau „Biodiversität und verantwortungsvolles Management“